Come ogni agente farmacologico, Genotropin pfizer ha una serie di controindicazioni, tra le quali si possono distinguere le seguenti:

1. Ipertensione intracranica;
2. La presenza di tumori maligni e neoplasie nel corpo;
3. Malattie renali;
4. Il periodo di gravidanza o allattamento;
5. Mancanza di respiro e privazione di ossigeno;
6. Ipersensibilità a uno qualsiasi dei componenti inclusi nell'iniezione.

Anche i diabetici dovrebbero usare il farmaco con estrema cautela, perché in caso di iniezioni è necessario monitorare più da vicino il livello di zucchero nel sangue. 

L'effetto dell'ormone della crescita sulla salute generale può anche cambiare se assunto contemporaneamente ad altri farmaci e complessi ormonali.